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doc/Eqs/angle_cosine_shift.tex

@@ -0,0 +1,9 @@
+\documentstyle[12pt]{article}
+
+\begin{document}
+
+$$
+E=-\frac{Umin}{2} \left[ 1+Cos(\theta-\theta_0) \right]
+$$
+
+\end{document}

doc/Eqs/angle_cosine_shift_exp.tex

@@ -0,0 +1,10 @@
+\documentstyle[12pt]{article}
+
+\begin{document}
+
+$$
+E=-Umin \frac{Exp(-a U(\theta,\theta_0))-1\right}{Exp(a)-1}\quad\mbox{with}\quad
+U(\theta,\theta_0)=0.5 \left(-cos[\theta-\theta_0]-1 \right)
+$$
+
+\end{document}

doc/Eqs/bond_harmonic_shift.tex

@@ -0,0 +1,9 @@
+\documentclass[12pt]{article}
+
+\begin{document}
+
+$$
+   E = \frac{Umin}{(r_0-r_c)^2} \left[ (r-r_0)^2-(r_c-r_0)^2 \right] 
+$$
+
+\end{document}

doc/Eqs/bond_harmonic_shift_cut.tex

@@ -0,0 +1,9 @@
+\documentclass[12pt]{article}
+
+\begin{document}
+
+$$
+   E = \frac{Umin}{(r_0-r_c)^2} \left[ (r-r_0)^2-(r_c-r_0)^2 \right] 
+$$
+
+\end{document}

doc/Eqs/dihedral_cosine_shift_exp.tex

@@ -0,0 +1,10 @@
+\documentstyle[12pt]{article}
+
+\begin{document}
+
+$$
+E=-Umin \frac{Exp(-a U(\theta,\theta_0))-1\right}{Exp(a)-1}\quad\mbox{with}\quad 
+U(\theta,\theta_0)=0.5 \left(-cos[\theta-\theta_0]-1 \right)
+$$
+
+\end{document}