forked from lijiext/lammps
git-svn-id: svn://svn.icms.temple.edu/lammps-ro/trunk@11357 f3b2605a-c512-4ea7-a41b-209d697bcdaa
This commit is contained in:
sjplimp
parent
a3d94884fc
commit
796c42ceb4
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@ -0,0 +1,13 @@
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|||
Disclaimer: Using these force fields for systems they
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have not been explicitly trained against may produce
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unrealistic results. Please see the README file in
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each subdirectory for more detailed information.
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F/C/H
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The follow information is reproduced from:
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"C_F_H (Fluorographene): Sandeep Kumar Singh, S. Goverapet Srinivasan, M. Neek-Amal, S. Costamagna, Adri C. T. van Duin, and F. M. Peeters Phys. Rev. B 87, 104114 (2013)."
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||||
- The ReaxFF force field parameters have been fit
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to a large quantum mechanics (QM) training set containing
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monolayer of fluorographene at various temperature.
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||||
File diff suppressed because it is too large
Load Diff
File diff suppressed because it is too large
Load Diff
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@ -0,0 +1,361 @@
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|||
Reactive MD-force field: Ni/C (Mueller et al., 2009)
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||||
39 ! Number of general parameters
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50.0000 !Overcoordination parameter
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||||
9.5469 !Overcoordination parameter
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||||
26.5405 !Valency angle conjugation parameter
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||||
1.7224 !Triple bond stabilisation parameter
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||||
6.8702 !Triple bond stabilisation parameter
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||||
60.4850 !C2-correction
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||||
1.0588 !Undercoordination parameter
|
||||
4.6000 !Triple bond stabilisation parameter
|
||||
12.1176 !Undercoordination parameter
|
||||
13.3056 !Undercoordination parameter
|
||||
-70.5044 !Triple bond stabilization energy
|
||||
0.0000 !Lower Taper-radius
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||||
10.0000 !Upper Taper-radius
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||||
2.8793 !Not used
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||||
33.8667 !Valency undercoordination
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||||
6.0891 !Valency angle/lone pair parameter
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||||
1.0563 !Valency angle
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||||
2.0384 !Valency angle parameter
|
||||
6.1431 !Not used
|
||||
6.9290 !Double bond/angle parameter
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||||
0.3842 !Double bond/angle parameter: overcoord
|
||||
2.9294 !Double bond/angle parameter: overcoord
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||||
-2.4837 !Not used
|
||||
5.7796 !Torsion/BO parameter
|
||||
10.0000 !Torsion overcoordination
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||||
1.9487 !Torsion overcoordination
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||||
-1.2327 !Conjugation 0 (not used)
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||||
2.1645 !Conjugation
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||||
1.5591 !vdWaals shielding
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||||
0.1000 !Cutoff for bond order (*100)
|
||||
2.1365 !Valency angle conjugation parameter
|
||||
0.6991 !Overcoordination parameter
|
||||
50.0000 !Overcoordination parameter
|
||||
1.8512 !Valency/lone pair parameter
|
||||
0.5000 !Not used
|
||||
20.0000 !Not used
|
||||
5.0000 !Molecular energy (not used)
|
||||
0.0000 !Molecular energy (not used)
|
||||
2.6962 !Valency angle conjugation parameter
|
||||
10 ! Nr of atoms; cov.r; valency;a.m;Rvdw;Evdw;gammaEEM;cov.r2;#
|
||||
alfa;gammavdW;valency;Eunder;Eover;chiEEM;etaEEM;n.u.
|
||||
cov r3;Elp;Heat inc.;n.u.;n.u.;n.u.;n.u.
|
||||
ov/un;val1;n.u.;val3,vval4
|
||||
C 1.3831 4.0000 12.0000 1.8814 0.1923 0.9000 1.1363 4.0000
|
||||
9.7821 2.1317 4.0000 30.0000 79.5548 5.9666 7.0000 0.0000
|
||||
1.2071 0.0000 186.1720 9.0068 34.9357 13.5366 0.8563 0.0000
|
||||
-2.8983 2.5675 1.0564 4.0000 2.9663 0.0000 0.0000 0.0000
|
||||
H 0.8873 1.0000 1.0080 1.5420 0.0598 0.6883 -0.1000 1.0000
|
||||
8.1910 30.9706 1.0000 0.0000 121.1250 3.5768 10.5896 1.0000
|
||||
-0.1000 0.0000 54.0596 1.3986 2.1457 0.0003 1.0698 0.0000
|
||||
-15.7683 2.1488 1.0338 1.0000 2.8793 0.0000 0.0000 0.0000
|
||||
O 1.2450 2.0000 15.9990 2.3878 0.1023 1.0903 1.0548 6.0000
|
||||
10.5750 32.3923 4.0000 37.5000 116.0768 8.5000 7.5600 2.0000
|
||||
0.9049 -1.0100 70.1357 2.7162 3.2532 0.0021 0.9745 0.0000
|
||||
-3.6141 2.7025 1.0493 4.0000 2.9225 0.0000 0.0000 0.0000
|
||||
N 1.2333 3.0000 14.0000 1.9324 0.1376 0.8596 1.1748 5.0000
|
||||
10.0667 7.8431 4.0000 32.2482 100.0000 6.8418 6.3404 2.0000
|
||||
1.0433 13.7673 139.9837 2.1961 3.0696 2.7683 0.9745 0.0000
|
||||
-4.3875 2.6192 1.0183 4.0000 2.8793 0.0000 0.0000 0.0000
|
||||
S 1.9405 2.0000 32.0600 2.0677 0.2099 1.0336 1.5479 6.0000
|
||||
9.9575 4.9055 4.0000 52.9998 112.1416 5.6210 8.2545 2.0000
|
||||
1.4601 9.7177 71.1843 5.7487 23.2859 12.7147 0.9745 0.0000
|
||||
-11.0000 2.7466 1.0338 6.2998 2.8793 0.0000 0.0000 0.0000
|
||||
F 1.2100 1.0000 18.9984 1.8601 0.1200 0.3000 -0.1000 7.0000
|
||||
11.5000 7.5000 4.0000 9.2533 0.2000 9.0000 15.0000 0.0000
|
||||
-1.0000 35.0000 33.1268 6.9821 4.1799 1.0561 0.0000 0.0000
|
||||
-7.3000 2.6656 1.0493 4.0000 2.9225 0.0000 0.0000 0.0000
|
||||
Pt 1.9820 2.0000 195.0800 2.0423 0.3309 0.3738 -1.0000 2.0000
|
||||
12.3677 6.0083 2.0000 0.0000 0.0000 5.6538 6.2512 0.0000
|
||||
-1.0000 0.0000 142.6300 26.2350 3.2757 0.1586 0.8563 0.0000
|
||||
-13.0000 1.7934 1.0338 5.0000 2.5791 0.0000 0.0000 0.0000
|
||||
Cl 1.8500 1.0000 35.4500 2.0155 0.2300 0.8218 -1.0000 7.0000
|
||||
11.5000 8.1330 1.0000 0.0000 0.0000 8.5038 8.0852 0.0000
|
||||
-1.0000 0.0000 42.6300 6.2293 5.2294 0.1542 0.8563 0.0000
|
||||
-10.2080 2.9867 1.0338 1.0000 2.5791 0.0000 0.0000 0.0000
|
||||
Ni 1.8201 2.0000 58.6900 1.9449 0.1880 0.8218 0.1000 2.0000
|
||||
12.1594 3.8387 2.0000 0.0000 0.0000 4.8038 7.3852 0.0000
|
||||
-1.0000 0.0000 95.6300 50.6786 0.6762 0.0981 0.8563 0.0000
|
||||
-3.7733 3.6035 1.0338 8.0000 2.5791 0.0000 0.0000 0.0000
|
||||
X -0.1000 2.0000 1.0080 2.0000 0.0000 1.0000 -0.1000 6.0000
|
||||
10.0000 2.5000 4.0000 0.0000 0.0000 8.5000 1.5000 0.0000
|
||||
-0.1000 0.0000 -2.3700 8.7410 13.3640 0.6690 0.9745 0.0000
|
||||
-11.0000 2.7466 1.0338 2.0000 2.8793 0.0000 0.0000 0.0000
|
||||
39 ! Nr of bonds; Edis1;LPpen;n.u.;pbe1;pbo5;13corr;pbo6
|
||||
pbe2;pbo3;pbo4;n.u.;pbo1;pbo2;ovcorr
|
||||
1 1 143.3883 96.3926 76.4404 -0.7767 -0.4710 1.0000 34.9900 0.5108
|
||||
0.4271 -0.1116 9.0638 1.0000 -0.0840 6.7452 1.0000 0.0000
|
||||
1 2 181.9084 0.0000 0.0000 -0.4768 0.0000 1.0000 6.0000 0.7499
|
||||
12.8085 1.0000 0.0000 1.0000 -0.0608 6.9928 0.0000 0.0000
|
||||
2 2 168.2342 0.0000 0.0000 -0.2191 0.0000 1.0000 6.0000 1.0062
|
||||
6.1152 1.0000 0.0000 1.0000 -0.0889 6.0000 0.0000 0.0000
|
||||
1 3 158.6946 107.4583 23.3136 -0.4240 -0.1743 1.0000 10.8209 1.0000
|
||||
0.5322 -0.3113 7.0000 1.0000 -0.1447 5.2450 0.0000 0.0000
|
||||
3 3 200.0000 230.7321 50.8293 0.2506 -0.1000 1.0000 29.7503 0.6051
|
||||
0.3451 -0.1055 9.0000 1.0000 -0.1225 5.5000 1.0000 0.0000
|
||||
1 4 134.1215 140.2179 79.9745 0.0163 -0.1428 1.0000 27.0617 0.2000
|
||||
0.1387 -0.3681 7.1611 1.0000 -0.1000 5.0825 1.0000 0.0000
|
||||
3 4 130.8596 169.4551 40.0000 0.3837 -0.1639 1.0000 35.0000 0.2000
|
||||
1.0000 -0.3579 7.0004 1.0000 -0.1193 6.8773 1.0000 0.0000
|
||||
4 4 157.9384 82.5526 152.5336 0.4010 -0.1034 1.0000 12.4261 0.5828
|
||||
0.1578 -0.1509 11.9186 1.0000 -0.0861 5.4271 1.0000 0.0000
|
||||
2 3 163.1043 0.0000 0.0000 -0.4155 0.0000 1.0000 6.0000 0.3607
|
||||
1.9380 1.0000 0.0000 0.0000 -0.0778 4.3082 0.0000 0.0000
|
||||
2 4 231.8173 0.0000 0.0000 -0.3364 0.0000 1.0000 6.0000 0.4402
|
||||
8.8910 1.0000 0.0000 1.0000 -0.0327 6.5754 0.0000 0.0000
|
||||
1 5 128.7959 56.4134 39.0716 0.0688 -0.4463 1.0000 31.1766 0.4530
|
||||
0.1955 -0.3587 6.2148 1.0000 -0.0770 6.6386 1.0000 0.0000
|
||||
2 5 136.1049 0.0000 0.0000 -0.4669 0.0000 1.0000 6.0000 0.3803
|
||||
10.5730 1.0000 0.0000 1.0000 -0.1000 7.0000 1.0000 0.0000
|
||||
3 5 165.3308 220.0000 40.0000 0.7131 -0.2406 1.0000 22.1005 0.2000
|
||||
0.8027 -0.2748 8.3393 1.0000 -0.1043 5.6108 1.0000 0.0000
|
||||
4 5 130.0000 180.0000 0.0000 0.5000 -0.2000 1.0000 40.0000 0.3000
|
||||
0.4000 -0.2500 9.0000 1.0000 -0.1000 6.0000 1.0000 0.0000
|
||||
5 5 96.1871 93.7006 68.6860 0.0955 -0.4781 1.0000 17.8574 0.6000
|
||||
0.2723 -0.2373 9.7875 1.0000 -0.0950 6.4757 1.0000 0.0000
|
||||
1 6 237.8781 0.0000 0.0000 -0.7438 -0.5000 1.0000 35.0000 1.0460
|
||||
3.6661 -0.2500 15.0000 1.0000 -0.0800 5.4719 1.0000 0.0000
|
||||
2 6 0.0000 0.0000 0.0000 -0.4643 0.0000 1.0000 6.0000 0.6151
|
||||
12.3710 1.0000 0.0000 1.0000 -0.1008 8.5980 0.0000 0.0000
|
||||
3 6 0.0000 0.0000 0.0000 0.2500 -0.5000 1.0000 45.0000 0.6000
|
||||
0.4000 -0.2500 15.0000 1.0000 -0.1000 10.0000 1.0000 0.0000
|
||||
4 6 0.0000 0.0000 0.0000 -0.4643 0.0000 1.0000 6.0000 0.6151
|
||||
12.3710 1.0000 0.0000 1.0000 -0.0098 8.5980 0.0000 0.0000
|
||||
5 6 0.0000 0.0000 0.0000 0.2500 -0.5000 1.0000 45.0000 0.6000
|
||||
0.4000 -0.2500 15.0000 1.0000 -0.1000 10.0000 1.0000 0.0000
|
||||
6 6 250.0765 0.0000 0.0000 0.2298 -0.3500 1.0000 25.0000 0.8427
|
||||
0.1167 -0.2500 15.0000 1.0000 -0.1506 7.3516 1.0000 0.0000
|
||||
6 7 -0.0100 0.0000 0.0000 0.9248 -0.3500 1.0000 35.0000 0.1231
|
||||
0.3064 -0.2500 25.0000 1.0000 -0.1903 8.4146 1.0000 0.0000
|
||||
1 7 164.4424 0.0000 0.0000 -0.0754 -0.2000 1.0000 16.0000 0.4351
|
||||
0.9325 -0.2000 15.0000 1.0000 -0.1809 7.3578 1.0000 0.0000
|
||||
2 7 158.0215 0.0000 0.0000 -0.2597 0.0000 1.0000 6.0000 0.2532
|
||||
36.8276 1.0000 0.0000 1.0000 -0.0837 10.5233 0.0000 0.0000
|
||||
3 7 184.0448 0.0000 0.0000 -0.6623 -0.2000 1.0000 16.0000 0.0151
|
||||
0.6439 -0.2000 15.0000 1.0000 -0.1422 5.0000 1.0000 0.0000
|
||||
4 7 183.3242 0.0000 0.0000 0.5441 -0.2000 1.0000 16.0000 0.6888
|
||||
-0.0634 -0.2000 15.0000 1.0000 -0.1558 5.0000 1.0000 0.0000
|
||||
5 7 0.0000 0.0000 0.0000 0.2500 -0.5000 1.0000 45.0000 0.6000
|
||||
0.4000 -0.2500 15.0000 1.0000 -0.1000 10.0000 1.0000 0.0000
|
||||
7 7 122.1369 0.0000 0.0000 -0.3578 -0.2000 0.0000 16.0000 0.2877
|
||||
0.9897 -0.2000 15.0000 1.0000 -0.0853 5.4801 0.0000 0.0000
|
||||
1 8 50.6675 0.0000 0.0000 0.0004 -0.2000 0.0000 16.0000 0.3115
|
||||
1.0000 -0.2000 15.0000 1.0000 -0.1062 5.1596 0.0000 0.0000
|
||||
2 8 50.6675 0.0000 0.0000 0.0004 -0.2000 0.0000 16.0000 0.3115
|
||||
1.0000 -0.2000 15.0000 1.0000 -0.1062 5.1596 0.0000 0.0000
|
||||
3 8 50.6675 0.0000 0.0000 0.0004 -0.2000 0.0000 16.0000 0.3115
|
||||
1.0000 -0.2000 15.0000 1.0000 -0.1062 5.1596 0.0000 0.0000
|
||||
4 8 50.6675 0.0000 0.0000 0.0004 -0.2000 0.0000 16.0000 0.3115
|
||||
1.0000 -0.2000 15.0000 1.0000 -0.1062 5.1596 0.0000 0.0000
|
||||
7 8 140.6675 0.0000 0.0000 0.0004 -0.2000 0.0000 16.0000 0.3115
|
||||
1.0000 -0.2000 15.0000 1.0000 -0.1062 5.1596 0.0000 0.0000
|
||||
8 8 125.6675 0.0000 0.0000 0.0004 -0.2000 0.0000 16.0000 0.3115
|
||||
1.0000 -0.2000 15.0000 1.0000 -0.1062 7.0000 0.0000 0.0000
|
||||
1 9 83.5810 9.0383 0.0000 0.2531 -0.2000 1.0000 16.0000 0.0529
|
||||
1.4085 -0.1113 13.3900 1.0000 -0.1436 4.5683 1.0000 0.0000
|
||||
2 9 114.7566 0.0000 0.0000 -0.8939 0.0000 1.0000 6.0000 0.1256
|
||||
0.1054 1.0000 0.0000 1.0000 -0.1196 5.0815 0.0000 0.0000
|
||||
3 9 118.6999 0.0000 0.0000 -0.1042 -0.2000 1.0000 16.0000 0.1724
|
||||
0.8280 -0.2500 15.0000 1.0000 -0.1013 5.6326 1.0000 0.0000
|
||||
9 9 91.2220 0.0000 0.0000 -0.2538 -0.2000 0.0000 16.0000 0.2688
|
||||
1.4651 -0.2000 15.0000 1.0000 -0.1435 4.3908 0.0000 0.0000
|
||||
7 9 68.1705 0.0000 0.0000 0.9869 -0.2000 0.0000 16.0000 0.0100
|
||||
0.2118 -0.2000 15.0000 1.0000 -0.2148 4.0000 0.0000 0.0000
|
||||
21 ! Nr of off-diagonal terms; Ediss;Ro;gamma;rsigma;rpi;rpi2
|
||||
1 2 0.1188 1.4017 9.8545 1.1203 -1.0000 -1.0000
|
||||
2 3 0.0299 1.3153 10.9102 0.9093 -1.0000 -1.0000
|
||||
2 4 0.1059 1.8290 9.7818 0.9598 -1.0000 -1.0000
|
||||
1 3 0.1156 1.8520 9.8317 1.2854 1.1352 1.0706
|
||||
1 4 0.1447 1.8766 9.7990 1.3436 1.1885 1.1363
|
||||
3 4 0.1048 2.0003 10.1220 1.3173 1.1096 1.0206
|
||||
1 5 0.1408 1.8161 9.9393 1.7986 1.3021 1.4031
|
||||
2 5 0.0895 1.6239 10.0104 1.4640 -1.0000 -1.0000
|
||||
3 5 0.2250 1.7911 10.2423 1.4546 1.4011 -1.0000
|
||||
4 5 0.1505 1.9000 10.5104 1.8000 1.4000 -1.0000
|
||||
1 6 0.1071 1.6243 11.0402 1.3176 -1.0000 -1.0000
|
||||
2 6 0.0431 1.7204 10.3632 0.5386 -1.0000 -1.0000
|
||||
1 7 0.1204 1.6025 13.6892 1.8982 -1.0000 -1.0000
|
||||
2 7 0.0920 1.6015 11.1362 1.7404 -1.0000 -1.0000
|
||||
3 7 0.1042 2.0014 10.3651 1.5000 -1.0000 -1.0000
|
||||
4 7 0.1000 2.0294 12.2593 1.5743 -1.0000 -1.0000
|
||||
7 8 0.1847 2.1006 11.0261 1.7524 -1.0000 -1.0000
|
||||
1 9 0.0800 1.7085 10.0895 1.5504 1.4005 -1.0000
|
||||
2 9 0.0366 1.7306 11.1019 1.2270 -1.0000 -1.0000
|
||||
3 9 0.0504 1.7959 11.7893 1.4423 -1.0000 -1.0000
|
||||
7 9 0.1919 2.1352 12.2879 1.8319 -1.0000 -1.0000
|
||||
107 ! Nr of angles;at1;at2;at3;Thetao,o;ka;kb;pv1;pv2
|
||||
1 1 1 72.7917 38.5829 0.7209 0.0000 0.1409 17.4509 1.0670
|
||||
1 1 2 72.1533 14.2108 6.2512 0.0000 0.0100 0.0000 1.1022
|
||||
2 1 2 73.2608 24.9703 3.7807 0.0000 0.1335 0.0000 3.0461
|
||||
1 2 2 0.0000 0.0000 6.0000 0.0000 0.0000 0.0000 1.0400
|
||||
1 2 1 0.0000 7.5000 5.0000 0.0000 0.0000 0.0000 1.0400
|
||||
2 2 2 0.0000 27.9213 5.8635 0.0000 0.0000 0.0000 1.0400
|
||||
1 1 3 49.6811 7.1713 4.3889 0.0000 0.7171 10.2661 1.0463
|
||||
3 1 3 77.7473 40.1718 2.9802 -25.3063 1.6170 -46.1315 2.2503
|
||||
1 1 4 66.1305 12.4661 7.0000 0.0000 3.0000 50.0000 1.1880
|
||||
3 1 4 73.9544 12.4661 7.0000 0.0000 3.0000 0.0000 1.1880
|
||||
4 1 4 64.1581 12.4661 7.0000 0.0000 3.0000 0.0000 1.1880
|
||||
2 1 3 65.0000 13.8815 5.0583 0.0000 0.4985 0.0000 1.4900
|
||||
2 1 4 74.2929 31.0883 2.6184 0.0000 0.0755 0.0000 1.0500
|
||||
1 2 4 0.0000 0.0019 6.3000 0.0000 0.0000 0.0000 1.0400
|
||||
1 3 1 73.5312 44.7275 0.7354 0.0000 3.0000 0.0000 1.0684
|
||||
1 3 3 79.4761 36.3701 1.8943 0.0000 0.7351 67.6777 3.0000
|
||||
1 3 4 82.4890 31.4554 0.9953 0.0000 1.6310 0.0000 1.0783
|
||||
3 3 3 80.7324 30.4554 0.9953 0.0000 1.6310 50.0000 1.0783
|
||||
3 3 4 84.3637 31.4554 0.9953 0.0000 1.6310 0.0000 1.0783
|
||||
4 3 4 89.7071 31.4554 0.9953 0.0000 1.6310 0.0000 1.1519
|
||||
1 3 2 70.1880 20.9562 0.3864 0.0000 0.0050 0.0000 1.6924
|
||||
2 3 3 75.6935 25.0000 2.0000 0.0000 1.0000 0.0000 1.1680
|
||||
2 3 4 75.6201 18.7919 0.9833 0.0000 0.1218 0.0000 1.0500
|
||||
2 3 2 77.3619 4.8342 7.1628 0.0000 2.9933 0.0000 1.5948
|
||||
1 4 1 66.0330 22.0295 1.4442 0.0000 1.6777 0.0000 1.0500
|
||||
1 4 3 103.3204 33.0381 0.5787 0.0000 1.6777 0.0000 1.0500
|
||||
1 4 4 104.1335 8.6043 1.6495 0.0000 1.6777 0.0000 1.0500
|
||||
3 4 3 74.1978 42.1786 1.7845 -18.0069 1.6777 0.0000 1.0500
|
||||
3 4 4 74.8600 43.7354 1.1572 -0.9193 1.6777 0.0000 1.0500
|
||||
4 4 4 75.0538 14.8267 5.2794 0.0000 1.6777 0.0000 1.0500
|
||||
1 4 2 69.1106 25.5067 1.1003 0.0000 0.0222 0.0000 1.0369
|
||||
2 4 3 81.3686 40.0712 2.2396 0.0000 0.0222 0.0000 1.0369
|
||||
2 4 4 83.0104 43.4766 1.5328 0.0000 0.0222 0.0000 1.0500
|
||||
2 4 2 70.8687 12.0168 5.0132 0.0000 0.0222 0.0000 1.1243
|
||||
1 2 3 0.0000 25.0000 3.0000 0.0000 1.0000 0.0000 1.0400
|
||||
1 2 4 0.0000 0.0019 6.0000 0.0000 0.0000 0.0000 1.0400
|
||||
1 2 5 0.0000 0.0019 6.0000 0.0000 0.0000 0.0000 1.0400
|
||||
3 2 3 0.0000 4.4124 2.5758 0.0000 0.0000 0.0000 2.9884
|
||||
3 2 4 0.0000 0.0019 6.0000 0.0000 0.0000 0.0000 1.0400
|
||||
4 2 4 0.0000 0.0019 6.0000 0.0000 0.0000 0.0000 1.0400
|
||||
2 2 3 0.0000 15.0000 2.2970 0.0000 0.0000 0.0000 1.3268
|
||||
2 2 4 0.0000 0.0019 6.0000 0.0000 0.0000 0.0000 1.0400
|
||||
1 1 5 74.4180 33.4273 1.7018 0.1463 0.5000 0.0000 1.6178
|
||||
1 5 1 79.7037 28.2036 1.7073 0.1463 0.5000 0.0000 1.6453
|
||||
2 1 5 63.3289 29.4225 2.1326 0.0000 0.5000 0.0000 3.0000
|
||||
1 5 2 85.9449 38.3109 1.2492 0.0000 0.5000 0.0000 1.1000
|
||||
1 5 5 85.6645 40.0000 2.9274 0.1463 0.5000 0.0000 1.3830
|
||||
2 5 2 83.8555 5.1317 0.4377 0.0000 0.5000 0.0000 3.0000
|
||||
2 5 5 97.0064 32.1121 2.0242 0.0000 0.5000 0.0000 2.8568
|
||||
3 5 3 81.0957 22.5308 7.4511 -2.3089 2.8609 0.0000 2.0914
|
||||
1 5 3 70.0000 35.0000 3.4223 0.0000 1.3550 0.0000 1.2002
|
||||
1 3 5 58.9977 36.2016 1.7948 0.0000 0.4304 0.0000 3.0000
|
||||
3 3 5 83.9753 31.0715 3.5590 0.0000 0.8161 0.0000 1.1776
|
||||
2 3 5 90.0000 17.5000 3.5000 0.0000 1.9770 0.0000 3.0000
|
||||
1 1 6 74.0446 35.8484 6.6125 0.0000 0.9453 0.0000 3.0000
|
||||
6 1 6 77.8443 49.0744 5.9913 0.0000 0.7835 0.0000 2.3020
|
||||
1 6 1 0.0000 19.9962 3.2299 0.0000 2.1012 0.0000 1.1537
|
||||
1 6 6 0.0000 25.0000 1.0000 0.0000 1.0000 0.0000 1.0400
|
||||
6 1 2 69.6421 10.0000 2.0000 0.0000 1.0000 0.0000 1.0400
|
||||
3 1 6 70.0000 35.0000 2.0000 0.0000 1.0000 0.0000 1.2500
|
||||
5 1 6 70.0000 35.0000 3.4223 0.0000 1.3550 0.0000 1.2002
|
||||
1 1 7 47.5496 27.7661 4.1587 0.0000 0.1071 0.0000 2.7036
|
||||
7 1 7 32.1368 20.4375 5.6452 0.0000 0.1000 0.0000 1.0500
|
||||
1 7 7 45.9456 1.0000 0.2000 0.0000 0.9740 0.0000 2.9993
|
||||
1 7 1 37.5291 7.4679 1.6697 0.0000 1.0031 0.0000 2.2937
|
||||
2 1 7 31.8742 14.6779 8.0000 0.0000 0.1000 0.0000 1.5559
|
||||
1 7 2 80.6353 1.0000 0.2000 0.5000 1.2901 0.0000 1.1404
|
||||
1 2 7 0.0000 1.0000 0.3609 0.0000 0.2947 0.0000 2.6479
|
||||
2 7 2 115.2319 50.0000 1.6748 0.0000 0.6983 0.0000 1.1000
|
||||
2 2 7 0.0000 34.3910 1.7927 0.0000 -0.3560 0.0000 1.7376
|
||||
3 2 7 0.0000 48.3620 2.0000 0.0000 1.0000 0.0000 1.2500
|
||||
7 2 7 0.0000 15.2364 3.1423 0.0000 0.8301 0.0000 2.2363
|
||||
2 7 7 88.3592 6.6793 5.5369 0.0000 1.2680 0.0000 1.2982
|
||||
7 3 7 96.8452 15.9175 8.8644 0.0000 0.4997 0.0000 1.5295
|
||||
3 7 7 94.9741 41.1348 2.2450 0.0000 0.1218 0.0000 1.9235
|
||||
3 3 7 88.7743 46.3505 1.2281 0.0000 0.6601 0.0000 1.7101
|
||||
3 7 3 54.6586 42.2173 0.5000 0.0000 0.3706 0.0000 1.3157
|
||||
1 7 3 89.0446 31.3538 3.2706 0.0000 2.2596 0.0000 1.1575
|
||||
1 3 7 88.1962 49.8841 9.8946 0.0000 3.6749 0.0000 1.1000
|
||||
3 1 7 105.7527 28.9984 9.4291 0.0000 -0.4379 0.0000 1.1000
|
||||
2 3 7 83.3202 43.6629 6.3865 0.0000 2.9392 0.0000 1.1266
|
||||
2 7 3 32.0466 49.7995 4.1312 0.5000 1.4682 0.0000 1.1000
|
||||
5 1 7 70.0000 35.0000 3.4223 0.0000 1.3550 0.0000 1.2002
|
||||
2 7 7 180.0000 -25.0000 20.0057 0.0000 1.4000 0.0000 1.1000
|
||||
7 2 8 0.0000 35.0000 3.0000 0.0000 0.0000 0.0000 1.0400
|
||||
5 3 7 70.0000 10.0000 1.0000 0.0000 0.1000 0.0000 2.8838
|
||||
1 9 1 62.5000 16.6806 0.7981 0.0000 0.9630 0.0000 1.0711
|
||||
1 1 9 87.6241 12.6504 1.8145 0.0000 0.6154 0.0000 1.5298
|
||||
9 1 9 100.0000 40.4895 1.6455 0.0000 0.0100 0.0000 1.7667
|
||||
1 9 9 5.0994 3.1824 0.7016 0.0000 0.7465 0.0000 2.2665
|
||||
3 9 3 49.6374 27.4219 1.6709 0.0000 0.0369 0.0000 2.5673
|
||||
3 3 9 90.0000 31.1442 5.0000 0.0000 0.5686 0.0000 2.0931
|
||||
9 3 9 42.4507 5.2354 0.5469 0.0000 1.5478 0.0000 1.0400
|
||||
3 9 9 39.2561 2.4303 3.7193 0.0000 0.8924 0.0000 1.9950
|
||||
2 9 2 106.3969 30.0000 0.9614 0.0000 1.9664 0.0000 2.2693
|
||||
2 2 9 0.0000 26.3327 4.6867 0.0000 0.8177 0.0000 1.0404
|
||||
9 2 9 0.0000 60.0000 1.8471 0.0000 0.6331 0.0000 1.8931
|
||||
2 9 9 30.3748 1.0000 4.8528 0.0000 0.1019 0.0000 3.1660
|
||||
2 9 9 180.0000 -27.2489 8.3752 0.0000 0.8112 0.0000 1.0004
|
||||
1 9 2 97.5742 10.9373 2.5200 0.0000 1.8558 0.0000 1.0000
|
||||
1 2 9 0.0000 0.2811 1.1741 0.0000 0.9136 0.0000 3.8138
|
||||
2 1 9 84.0006 45.0000 0.6271 0.0000 3.0000 0.0000 1.0000
|
||||
2 3 9 29.3808 16.2484 2.5832 0.5000 0.0100 0.0000 1.9017
|
||||
1 9 3 70.0000 25.0000 1.0000 0.0000 1.0000 0.0000 1.2500
|
||||
1 3 9 70.0000 25.0000 1.0000 0.0000 1.0000 0.0000 1.2500
|
||||
3 1 9 70.0000 25.0000 1.0000 0.0000 1.0000 0.0000 1.2500
|
||||
3 2 9 0.0000 7.1233 1.9895 0.5000 0.3233 0.0000 1.1000
|
||||
55 ! Nr of torsions;at1;at2;at3;at4;;V1;V2;V3;V2(BO);vconj;n.u;n
|
||||
1 1 1 1 -0.5000 53.0886 -0.1335 -6.2875 -1.9524 0.0000 0.0000
|
||||
1 1 1 2 -0.4614 29.0459 0.2551 -4.8555 -2.7007 0.0000 0.0000
|
||||
2 1 1 2 -0.2833 31.2867 0.2965 -4.8828 -2.4652 0.0000 0.0000
|
||||
1 1 1 3 -0.3495 22.2142 -0.2959 -2.5000 -1.9066 0.0000 0.0000
|
||||
2 1 1 3 0.0646 24.3195 0.6259 -3.9603 -1.0000 0.0000 0.0000
|
||||
3 1 1 3 -0.5456 5.5756 0.8433 -5.1924 -1.0180 0.0000 0.0000
|
||||
1 1 3 1 1.7555 27.9267 0.0072 -2.6533 -1.0000 0.0000 0.0000
|
||||
1 1 3 2 -1.4358 36.7830 -1.0000 -8.1821 -1.0000 0.0000 0.0000
|
||||
2 1 3 1 -1.3959 34.5053 0.7200 -2.5714 -2.1641 0.0000 0.0000
|
||||
2 1 3 2 -2.5000 70.0597 1.0000 -3.5539 -2.9929 0.0000 0.0000
|
||||
1 1 3 3 0.6852 11.2819 -0.4784 -2.5000 -2.1085 0.0000 0.0000
|
||||
2 1 3 3 0.1933 80.0000 1.0000 -4.0590 -3.0000 0.0000 0.0000
|
||||
3 1 3 1 -1.9889 76.4820 -0.1796 -3.8301 -3.0000 0.0000 0.0000
|
||||
3 1 3 2 0.2160 72.7707 -0.7087 -4.2100 -3.0000 0.0000 0.0000
|
||||
3 1 3 3 -2.5000 71.0772 0.2542 -3.1631 -3.0000 0.0000 0.0000
|
||||
1 3 3 1 2.5000 -0.6002 1.0000 -3.4297 -2.8858 0.0000 0.0000
|
||||
1 3 3 2 -2.5000 -3.3822 0.7004 -5.4467 -2.9586 0.0000 0.0000
|
||||
2 3 3 2 2.5000 -4.0000 0.9000 -2.5000 -1.0000 0.0000 0.0000
|
||||
1 3 3 3 1.2329 -4.0000 1.0000 -2.5000 -1.7479 0.0000 0.0000
|
||||
2 3 3 3 0.8302 -4.0000 -0.7763 -2.5000 -1.0000 0.0000 0.0000
|
||||
3 3 3 3 -2.5000 -4.0000 1.0000 -2.5000 -1.0000 0.0000 0.0000
|
||||
0 1 2 0 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000
|
||||
0 2 2 0 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000
|
||||
0 2 3 0 0.0000 0.1000 0.0200 -2.5415 0.0000 0.0000 0.0000
|
||||
0 1 1 0 0.0000 50.0000 0.3000 -4.0000 -2.0000 0.0000 0.0000
|
||||
0 3 3 0 0.5511 25.4150 1.1330 -5.1903 -1.0000 0.0000 0.0000
|
||||
0 1 4 0 -2.4242 128.1636 0.3739 -6.6098 -2.0000 0.0000 0.0000
|
||||
0 2 4 0 0.0000 0.1000 0.0200 -2.5415 0.0000 0.0000 0.0000
|
||||
0 3 4 0 1.4816 55.6641 0.0004 -7.0465 -2.7203 0.0000 0.0000
|
||||
0 4 4 0 -0.3244 27.7086 0.0039 -2.8272 -2.0000 0.0000 0.0000
|
||||
4 1 4 4 -5.5181 8.9706 0.0004 -6.1782 -2.0000 0.0000 0.0000
|
||||
0 1 5 0 3.3423 30.3435 0.0365 -2.7171 0.0000 0.0000 0.0000
|
||||
0 5 5 0 -0.0555 -5.0000 0.1515 -2.2056 0.0000 0.0000 0.0000
|
||||
0 2 5 0 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000
|
||||
1 1 1 6 0.5000 0.1000 0.4683 -11.5274 -1.7255 0.0000 0.0000
|
||||
2 1 1 6 0.0000 49.3871 0.2000 -10.5765 -1.7255 0.0000 0.0000
|
||||
6 1 1 6 -0.5000 95.4727 -0.2080 -4.8579 -1.7255 0.0000 0.0000
|
||||
0 1 6 0 4.0000 45.8264 0.9000 -4.0000 0.0000 0.0000 0.0000
|
||||
0 6 6 0 4.0000 45.8264 0.9000 -4.0000 0.0000 0.0000 0.0000
|
||||
2 3 7 7 0.0000 0.0100 0.0100 -5.2275 0.0000 0.0000 0.0000
|
||||
2 3 3 7 2.5000 8.9261 2.0000 -2.5710 -1.0000 0.0000 0.0000
|
||||
7 3 3 7 1.8548 50.0000 0.0100 -4.2239 -1.0000 0.0000 0.0000
|
||||
2 3 1 7 0.0654 10.5105 0.0100 -4.7886 -1.0000 0.0000 0.0000
|
||||
1 1 1 7 0.5732 40.5542 0.7425 -3.6935 0.0000 0.0000 0.0000
|
||||
7 1 1 7 -1.0102 40.4890 0.0100 -3.4787 0.0000 0.0000 0.0000
|
||||
2 1 1 7 2.5000 50.0000 2.0000 -7.0766 0.0000 0.0000 0.0000
|
||||
2 3 5 3 2.5000 2.5000 0.2237 -10.0000 -1.0000 0.0000 0.0000
|
||||
0 3 5 0 -2.5000 50.0000 -0.5000 -10.0000 -1.0000 0.0000 0.0000
|
||||
1 1 1 9 0.0000 5.0000 0.4000 -6.0000 0.0000 0.0000 0.0000
|
||||
9 1 1 9 0.0000 44.3024 0.4000 -4.0000 0.0000 0.0000 0.0000
|
||||
2 1 1 9 0.0000 21.7038 0.0100 -4.0000 0.0000 0.0000 0.0000
|
||||
2 1 9 1 0.0000 5.2500 0.0100 -6.0000 0.0000 0.0000 0.0000
|
||||
1 1 9 1 0.0000 5.1676 0.0100 -5.9539 0.0000 0.0000 0.0000
|
||||
1 1 9 2 0.0000 5.1676 0.0100 -5.9539 0.0000 0.0000 0.0000
|
||||
9 3 3 9 0.0509 30.0000 0.5000 -4.0000 0.0000 0.0000 0.0000
|
||||
9 ! Nr of hydrogen bonds;at1;at2;at3;Rhb;Dehb;vhb1
|
||||
3 2 3 2.1845 -2.3549 3.0582 19.1627
|
||||
3 2 4 1.6658 -3.8907 3.0582 19.1627
|
||||
4 2 3 1.8738 -3.5421 3.0582 19.1627
|
||||
4 2 4 1.8075 -4.1846 3.0582 19.1627
|
||||
3 2 5 1.5000 -2.0000 3.0582 19.1627
|
||||
4 2 5 1.5000 -2.0000 3.0582 19.1627
|
||||
5 2 3 1.5000 -2.0000 3.0582 19.1627
|
||||
5 2 4 1.5000 -2.0000 3.0582 19.1627
|
||||
5 2 5 1.5000 -2.0000 3.0582 19.1627
|
||||
|
|
@ -0,0 +1,34 @@
|
|||
# REAX potential for Nitroamines system
|
||||
# .....
|
||||
|
||||
dimension 3
|
||||
boundary p p p
|
||||
units real
|
||||
|
||||
atom_style charge
|
||||
read_data data.FC
|
||||
|
||||
pair_style reax/c NULL
|
||||
pair_coeff * * ffield.reax.FC 1 6
|
||||
neighbor 2. bin
|
||||
neigh_modify every 10 delay 0 check no
|
||||
fix 2 all qeq/reax 1 0.0 10.0 1e-6 reax/c
|
||||
|
||||
fix 1 all npt temp 100.0 100.0 10.0 iso 1.0 1. 2000.0
|
||||
timestep 0.2
|
||||
thermo_style custom step temp epair etotal press
|
||||
thermo 5000
|
||||
dump 4 all xyz 5000 dumpnpt.xyz
|
||||
run 50000
|
||||
unfix 1
|
||||
|
||||
fix 1 all nvt temp 100.0 100.0 100.0
|
||||
|
||||
thermo_style custom step temp epair etotal press
|
||||
thermo 5000
|
||||
timestep 0.2
|
||||
|
||||
#dump 5 all xyz 5000 dumpnvt.xyz
|
||||
#dump 6 all custom 5000 dumpidtype.dat id type x y z
|
||||
|
||||
run 1000000
|
||||
|
|
@ -0,0 +1,290 @@
|
|||
LAMMPS (20 Apr 2012)
|
||||
# REAX potential for Nitroamines system
|
||||
# .....
|
||||
dimension 3
|
||||
boundary p p p
|
||||
units real
|
||||
|
||||
atom_style charge
|
||||
read_data data.FC
|
||||
orthogonal box = (-82.62 -79.5011 -50) to (82.62 79.5011 50)
|
||||
2 by 2 by 1 MPI processor grid
|
||||
17280 atoms
|
||||
|
||||
pair_style reax/c NULL
|
||||
pair_coeff * * ffield.reax.FC 1 6
|
||||
neighbor 2. bin
|
||||
neigh_modify every 10 delay 0 check no
|
||||
fix 2 all qeq/reax 1 0.0 10.0 1e-6 reax/c
|
||||
|
||||
fix 1 all npt temp 100.0 100.0 10.0 iso 1.0 1. 2000.0
|
||||
timestep 0.2
|
||||
thermo_style custom step temp epair etotal press
|
||||
thermo 5000
|
||||
dump 4 all xyz 5000 dumpnpt.xyz
|
||||
run 50000
|
||||
Memory usage per processor = 17.0814 Mbytes
|
||||
Step Temp E_pair TotEng Press
|
||||
0 0 -808778.59 -808778.59 58533.588
|
||||
5000 105.0976 -2288632.1 -2283219 -1218.696
|
||||
10000 105.39426 -2289006.6 -2283578.2 68.009087
|
||||
15000 98.48711 -2289197.9 -2284125.2 -54.054399
|
||||
20000 98.533028 -2289017.9 -2283942.9 -227.39798
|
||||
25000 100.18985 -2289123 -2283962.7 -153.66846
|
||||
30000 98.309393 -2289116.6 -2284053.1 -703.29889
|
||||
35000 99.787535 -2289182.5 -2284042.9 335.48426
|
||||
40000 101.77175 -2289078.6 -2283836.8 -520.94317
|
||||
45000 101.67788 -2289091.4 -2283854.5 94.495971
|
||||
50000 100.34001 -2289108.8 -2283940.7 556.19254
|
||||
Loop time of 59536 on 4 procs for 50000 steps with 17280 atoms
|
||||
|
||||
Pair time (%) = 49797.2 (83.6422)
|
||||
Neigh time (%) = 120.404 (0.202237)
|
||||
Comm time (%) = 1688.07 (2.83538)
|
||||
Outpt time (%) = 0.322857 (0.000542289)
|
||||
Other time (%) = 7930 (13.3197)
|
||||
|
||||
Nlocal: 4320 ave 4320 max 4320 min
|
||||
Histogram: 4 0 0 0 0 0 0 0 0 0
|
||||
Nghost: 3012 ave 3012 max 3012 min
|
||||
Histogram: 4 0 0 0 0 0 0 0 0 0
|
||||
Neighs: 772466 ave 772473 max 772454 min
|
||||
Histogram: 1 0 0 0 0 0 0 1 1 1
|
||||
|
||||
Total # of neighbors = 3089866
|
||||
Ave neighs/atom = 178.812
|
||||
Neighbor list builds = 5000
|
||||
Dangerous builds = 0
|
||||
unfix 1
|
||||
|
||||
fix 1 all nvt temp 100.0 100.0 100.0
|
||||
|
||||
thermo_style custom step temp epair etotal press
|
||||
thermo 5000
|
||||
timestep 0.2
|
||||
|
||||
dump 5 all xyz 5000 dumpnvt.xyz
|
||||
dump 6 all custom 5000 dumpidtype.dat id type x y z
|
||||
run 1000000
|
||||
Memory usage per processor = 18.3439 Mbytes
|
||||
Step Temp E_pair TotEng Press
|
||||
50000 100.34001 -2289108.8 -2283940.7 556.19247
|
||||
55000 99.416793 -2289167.9 -2284047.4 -332.9324
|
||||
60000 100.50397 -2289127.6 -2283951.1 -279.46819
|
||||
65000 99.627748 -2289239.7 -2284108.3 264.83754
|
||||
70000 100.09179 -2289156.9 -2284001.7 283.15003
|
||||
75000 99.875249 -2289152 -2284007.9 -16.141953
|
||||
80000 99.746136 -2289171.6 -2284034.2 -391.23881
|
||||
85000 100.55434 -2289118.1 -2283939 32.494191
|
||||
90000 101.08317 -2289200.4 -2283994.1 41.698279
|
||||
95000 99.73164 -2289207.2 -2284070.5 -32.731004
|
||||
100000 98.922918 -2289131.1 -2284036.1 -187.36699
|
||||
105000 100.8282 -2289178.8 -2283985.6 -532.85003
|
||||
110000 100.40163 -2289147.2 -2283976 21.598
|
||||
115000 99.701975 -2289190.6 -2284055.4 -140.04817
|
||||
120000 100.41641 -2289173.6 -2284001.6 205.72112
|
||||
125000 100.44139 -2289179.7 -2284006.5 206.25445
|
||||
130000 99.819955 -2289225.9 -2284084.6 -138.45441
|
||||
135000 99.989518 -2289151.6 -2284001.6 121.26523
|
||||
140000 100.33212 -2289261.9 -2284094.3 259.81714
|
||||
145000 99.822641 -2289165.7 -2284024.3 44.828884
|
||||
150000 100.20695 -2289141.3 -2283980.1 548.07596
|
||||
155000 99.193961 -2289159.5 -2284050.4 -21.75754
|
||||
160000 100.07107 -2289156.5 -2284002.3 242.30129
|
||||
165000 100.06015 -2289162.1 -2284008.5 -156.84727
|
||||
170000 100.10577 -2289185.5 -2284029.6 173.1503
|
||||
175000 100.62101 -2289182.9 -2284000.4 -297.50872
|
||||
180000 99.650485 -2289198.6 -2284066.1 -374.0191
|
||||
185000 101.35155 -2289125.4 -2283905.3 -490.44905
|
||||
190000 99.707059 -2289166.7 -2284031.3 -174.61196
|
||||
195000 99.855321 -2289177 -2284033.9 -232.63272
|
||||
200000 100.2703 -2289169.9 -2284005.4 -276.87644
|
||||
205000 98.940474 -2289193.4 -2284097.4 420.46772
|
||||
210000 99.26387 -2289142.9 -2284030.2 263.61276
|
||||
215000 100.32931 -2289108.6 -2283941 -32.842414
|
||||
220000 99.978037 -2289207.4 -2284057.9 -194.82755
|
||||
225000 98.108737 -2289149.7 -2284096.5 -281.95994
|
||||
230000 99.351811 -2289118.2 -2284001.1 -14.058216
|
||||
235000 99.240306 -2289191.6 -2284080.2 149.41103
|
||||
240000 99.499952 -2289192.2 -2284067.4 184.20862
|
||||
245000 101.07539 -2289190.8 -2283984.8 193.30381
|
||||
250000 100.24212 -2289161.3 -2283998.3 178.569
|
||||
255000 98.919758 -2289165.7 -2284070.8 180.97666
|
||||
260000 99.908209 -2289179.1 -2284033.2 -278.71373
|
||||
265000 100.16467 -2289151.8 -2283992.8 615.57204
|
||||
270000 100.36053 -2289169.6 -2284000.5 237.40315
|
||||
275000 99.613064 -2289156.8 -2284026.2 -167.03489
|
||||
280000 99.337512 -2289155.6 -2284039.2 -460.50444
|
||||
285000 99.603881 -2289120.9 -2283990.8 168.46413
|
||||
290000 99.230635 -2289149.8 -2284038.8 236.29674
|
||||
295000 100.5619 -2289167.1 -2283987.6 -491.75014
|
||||
300000 99.385656 -2289154.1 -2284035.2 -363.13885
|
||||
305000 99.409417 -2289164.9 -2284044.7 -456.90806
|
||||
310000 100.75824 -2289213.4 -2284023.8 203.08587
|
||||
315000 100.78626 -2289176.9 -2283985.9 41.744902
|
||||
320000 100.25401 -2289219.1 -2284055.5 430.29767
|
||||
325000 101.56439 -2289166.9 -2283935.8 610.22112
|
||||
330000 100.62069 -2289175.5 -2283993 -308.79282
|
||||
335000 100.03494 -2289179.7 -2284027.3 -19.121724
|
||||
340000 100.63677 -2289182.9 -2283999.5 -359.81208
|
||||
345000 99.002697 -2289195.8 -2284096.6 -102.86569
|
||||
350000 100.07818 -2289134.5 -2283979.9 193.88032
|
||||
355000 100.77074 -2289149.8 -2283959.5 -14.609585
|
||||
360000 100.25801 -2289183.9 -2284020.1 -270.9849
|
||||
365000 100.25521 -2289152 -2283988.4 -33.580429
|
||||
370000 99.926977 -2289227.6 -2284080.8 -56.959224
|
||||
375000 100.52818 -2289146.6 -2283968.9 95.336143
|
||||
380000 100.17047 -2289169.5 -2284010.2 -319.60451
|
||||
385000 100.19534 -2289133.1 -2283972.5 -185.26643
|
||||
390000 100.37924 -2289169.4 -2283999.4 19.242318
|
||||
395000 99.460734 -2289191.3 -2284068.5 292.93652
|
||||
400000 99.841037 -2289160.4 -2284018 -17.787578
|
||||
405000 98.877335 -2289142.3 -2284049.6 -113.26882
|
||||
410000 99.758567 -2289193.3 -2284055.2 25.540041
|
||||
415000 100.04879 -2289146.6 -2283993.5 297.2552
|
||||
420000 98.860832 -2289141.1 -2284049.2 -226.78167
|
||||
425000 100.00145 -2289137.5 -2283986.9 -74.078873
|
||||
430000 99.749899 -2289201.6 -2284063.9 493.04322
|
||||
435000 100.69482 -2289109.5 -2283923.2 -242.08487
|
||||
440000 99.721 -2289135.9 -2283999.7 -339.64256
|
||||
445000 99.855329 -2289168.2 -2284025.1 414.71118
|
||||
450000 100.09249 -2289166.6 -2284011.3 335.08657
|
||||
455000 98.758452 -2289202.9 -2284116.3 -119.71249
|
||||
460000 99.174088 -2289104.6 -2283996.6 -283.15052
|
||||
465000 99.718569 -2289224.7 -2284088.6 -712.30655
|
||||
470000 100.24452 -2289183.4 -2284020.3 -239.99433
|
||||
475000 100.53367 -2289189.8 -2284011.8 -115.71725
|
||||
480000 100.40977 -2289170 -2283998.3 38.445946
|
||||
485000 101.23619 -2289127.6 -2283913.4 698.56495
|
||||
490000 99.459117 -2289150.8 -2284028.1 -262.96516
|
||||
495000 100.39728 -2289177.4 -2284006.4 -394.59563
|
||||
500000 99.116083 -2289226.6 -2284121.6 200.34486
|
||||
505000 99.91431 -2289188 -2284041.9 17.588436
|
||||
510000 100.85517 -2289131.7 -2283937.1 286.03491
|
||||
515000 99.363117 -2289169.6 -2284051.8 -317.0282
|
||||
520000 100.86159 -2289144.7 -2283949.8 143.76778
|
||||
525000 99.465981 -2289118.8 -2283995.8 208.51559
|
||||
530000 99.902705 -2289200 -2284054.5 -202.30181
|
||||
535000 100.19354 -2289163.7 -2284003.2 -67.570941
|
||||
540000 99.015537 -2289169.1 -2284069.3 48.8048
|
||||
545000 100.14986 -2289172.7 -2284014.5 -336.9817
|
||||
550000 100.17324 -2289179.4 -2284020 -29.17237
|
||||
555000 99.880047 -2289197.7 -2284053.4 112.87965
|
||||
560000 99.820275 -2289120 -2283978.7 -340.94746
|
||||
565000 99.515083 -2289176.9 -2284051.3 -440.31154
|
||||
570000 100.70354 -2289164.3 -2283977.5 206.5432
|
||||
575000 100.32739 -2289230.1 -2284062.7 -241.43649
|
||||
580000 99.754479 -2289133 -2283995.1 -81.028128
|
||||
585000 98.964925 -2289186.6 -2284089.4 -374.98039
|
||||
590000 100.0133 -2289180.4 -2284029.2 312.41873
|
||||
595000 99.848595 -2289198.6 -2284055.9 234.43719
|
||||
600000 99.683316 -2289128.8 -2283994.5 -148.53219
|
||||
605000 100.37737 -2289138 -2283968.1 -7.3581291
|
||||
610000 99.727059 -2289206 -2284069.5 94.994876
|
||||
615000 99.982014 -2289153.4 -2284003.7 -241.07445
|
||||
620000 99.979974 -2289171.3 -2284021.8 -360.06593
|
||||
625000 99.669776 -2289176.3 -2284042.8 -704.60088
|
||||
630000 99.668644 -2289131.4 -2283997.9 603.20455
|
||||
635000 99.901813 -2289254.1 -2284108.6 838.87745
|
||||
640000 100.68622 -2289161.3 -2283975.4 255.49128
|
||||
645000 98.7539 -2289179.7 -2284093.3 188.41285
|
||||
650000 100.18794 -2289157.6 -2283997.3 230.27604
|
||||
655000 99.407055 -2289212.4 -2284092.4 -679.0743
|
||||
660000 100.1511 -2289166.3 -2284008 -162.65176
|
||||
665000 99.199467 -2289187.6 -2284078.2 220.51682
|
||||
670000 99.876032 -2289158.3 -2284014.2 -230.99807
|
||||
675000 100.13446 -2289179.1 -2284021.6 -373.43881
|
||||
680000 99.456188 -2289166.9 -2284044.4 -71.038496
|
||||
685000 101.28607 -2289175.6 -2283958.9 134.49528
|
||||
690000 101.03888 -2289224.9 -2284020.8 -458.83318
|
||||
695000 99.905801 -2289178.8 -2284033.1 274.12883
|
||||
700000 99.776278 -2289085.1 -2283946.1 -52.026505
|
||||
705000 100.02389 -2289170.9 -2284019.1 -109.95434
|
||||
710000 99.61194 -2289258 -2284127.4 132.01881
|
||||
715000 99.933182 -2289148.8 -2284001.7 194.38882
|
||||
720000 99.631604 -2289228.9 -2284097.3 314.22911
|
||||
725000 100.46146 -2289227.7 -2284053.4 82.342287
|
||||
730000 100.36883 -2289112.2 -2283942.7 -141.39062
|
||||
735000 99.872899 -2289187.7 -2284043.7 -136.26692
|
||||
740000 99.646181 -2289234.5 -2284102.2 -85.24176
|
||||
745000 100.14716 -2289162.3 -2284004.2 -379.152
|
||||
750000 99.855733 -2289168.9 -2284025.8 -370.16318
|
||||
755000 99.553418 -2289200.3 -2284072.8 6.5422998
|
||||
760000 100.73939 -2289185.7 -2283997.1 304.13498
|
||||
765000 99.634485 -2289163.5 -2284031.8 103.85227
|
||||
770000 98.884018 -2289141.5 -2284048.5 521.35756
|
||||
775000 99.845631 -2289160.7 -2284018.1 -372.38623
|
||||
780000 99.85652 -2289157.3 -2284014.2 -87.209706
|
||||
785000 100.47747 -2289139.1 -2283964 -226.03012
|
||||
790000 100.19758 -2289168.3 -2284007.5 765.9905
|
||||
795000 100.69522 -2289153 -2283966.7 -103.91121
|
||||
800000 100.13307 -2289201.3 -2284043.9 29.686574
|
||||
805000 100.3382 -2289156.2 -2283988.3 -170.0457
|
||||
810000 99.081858 -2289133.1 -2284029.8 -27.939572
|
||||
815000 101.20011 -2289131.7 -2283919.4 -13.871151
|
||||
820000 99.436937 -2289167.4 -2284045.9 52.83935
|
||||
825000 101.11109 -2289152.1 -2283944.3 -90.776527
|
||||
830000 100.06802 -2289183.6 -2284029.6 -50.332039
|
||||
835000 100.95845 -2289191.7 -2283991.8 512.51532
|
||||
840000 101.07462 -2289144.3 -2283938.4 -609.14046
|
||||
845000 99.117372 -2289151.5 -2284046.4 215.18197
|
||||
850000 101.42711 -2289111.4 -2283887.3 198.2651
|
||||
855000 100.13874 -2289219.2 -2284061.5 -101.56708
|
||||
860000 100.0713 -2289177.8 -2284023.6 -258.52103
|
||||
865000 99.901411 -2289175.3 -2284029.8 -311.07755
|
||||
870000 100.05715 -2289194.2 -2284040.7 -93.908292
|
||||
875000 99.94302 -2289106.9 -2283959.3 -188.1219
|
||||
880000 100.36712 -2289221 -2284051.5 372.38133
|
||||
885000 99.719392 -2289170.4 -2284034.3 284.31873
|
||||
890000 99.886141 -2289193.7 -2284049 -179.31915
|
||||
895000 100.08584 -2289194.1 -2284039.1 -173.91457
|
||||
900000 99.290024 -2289147.8 -2284033.9 -18.996504
|
||||
905000 99.187734 -2289178.3 -2284069.6 178.87563
|
||||
910000 101.38738 -2289158.4 -2283936.4 441.08922
|
||||
915000 100.7167 -2289231.3 -2284043.8 268.01755
|
||||
920000 100.26661 -2289142.6 -2283978.3 -511.94455
|
||||
925000 100.18653 -2289189.9 -2284029.8 559.46306
|
||||
930000 100.15348 -2289151.7 -2283993.3 -207.333
|
||||
935000 100.22696 -2289170.5 -2284008.3 164.10594
|
||||
940000 99.847175 -2289191.2 -2284048.6 118.98695
|
||||
945000 100.87876 -2289154.5 -2283958.7 -22.134492
|
||||
950000 100.39875 -2289194.7 -2284023.6 37.925461
|
||||
955000 99.637623 -2289240.3 -2284108.4 334.08371
|
||||
960000 100.31831 -2289143.9 -2283977 4.9524388
|
||||
965000 100.72699 -2289168.2 -2283980.2 -84.273319
|
||||
970000 99.086475 -2289174.3 -2284070.8 -24.948104
|
||||
975000 100.1073 -2289107.8 -2283951.7 5.4029565
|
||||
980000 100.31595 -2289203.7 -2284036.9 32.104294
|
||||
985000 100.53494 -2289111.9 -2283933.8 -102.74797
|
||||
990000 99.806334 -2289189.5 -2284049 -38.504257
|
||||
995000 100.93534 -2289192.7 -2283993.9 -667.71394
|
||||
1000000 99.611 -2289154.4 -2284023.9 200.78107
|
||||
1005000 100.29646 -2289196.7 -2284030.9 233.2125
|
||||
1010000 100.14351 -2289119.1 -2283961.2 157.94143
|
||||
1015000 99.814377 -2289201.1 -2284060.2 -711.3721
|
||||
1020000 99.43908 -2289105.7 -2283984 -67.542151
|
||||
1025000 99.539063 -2289191.2 -2284064.4 158.09411
|
||||
1030000 99.857978 -2289141 -2283997.8 693.87912
|
||||
1035000 100.22471 -2289135.8 -2283973.6 -63.089985
|
||||
1040000 98.671274 -2289135.9 -2284053.8 -464.78354
|
||||
1045000 100.86008 -2289106.7 -2283911.9 -454.34847
|
||||
1050000 99.836464 -2289205.9 -2284063.8 -76.851622
|
||||
Loop time of 1.18324e+06 on 4 procs for 1000000 steps with 17280 atoms
|
||||
|
||||
Pair time (%) = 989104 (83.593)
|
||||
Neigh time (%) = 2409.21 (0.203611)
|
||||
Comm time (%) = 33773.7 (2.85434)
|
||||
Outpt time (%) = 20.251 (0.00171149)
|
||||
Other time (%) = 157931 (13.3474)
|
||||
|
||||
Nlocal: 4320 ave 4320 max 4320 min
|
||||
Histogram: 4 0 0 0 0 0 0 0 0 0
|
||||
Nghost: 3011.75 ave 3012 max 3011 min
|
||||
Histogram: 1 0 0 0 0 0 0 0 0 3
|
||||
Neighs: 772407 ave 772439 max 772380 min
|
||||
Histogram: 2 0 0 0 0 0 0 1 0 1
|
||||
|
||||
Total # of neighbors = 3089629
|
||||
Ave neighs/atom = 178.798
|
||||
Neighbor list builds = 100000
|
||||
Dangerous builds = 0
|
||||
|
|
@ -0,0 +1,15 @@
|
|||
This LAMMPS simulation made specific use of work described in the
|
||||
following references. See http://lammps.sandia.gov/cite.html
|
||||
for details.
|
||||
|
||||
pair reax/c command:
|
||||
|
||||
@Article{Aktulga12,
|
||||
author = {H. M. Aktulga, J. C. Fogarty, S. A. Pandit, A. Y. Grama},
|
||||
title = {Parallel reactive molecular dynamics: Numerical methods and algorithmic techniques},
|
||||
journal = {Parallel Computing},
|
||||
year = 2012,
|
||||
volume = 38,
|
||||
pages = {245--259}
|
||||
}
|
||||
|
||||
|
|
@ -0,0 +1,18 @@
|
|||
LAMMPS (30 Jan 2014)
|
||||
# REAX potential for Nitroamines system
|
||||
# .....
|
||||
|
||||
dimension 3
|
||||
boundary p p p
|
||||
units real
|
||||
|
||||
atom_style charge
|
||||
read_data data.FC
|
||||
orthogonal box = (-82.62 -79.5011 -50) to (82.62 79.5011 50)
|
||||
1 by 1 by 1 MPI processor grid
|
||||
reading atoms ...
|
||||
17280 atoms
|
||||
|
||||
pair_style reax/c NULL
|
||||
pair_coeff * * ffield.reax.FC 1 6
|
||||
ERROR: Non-existent ReaxFF type (../pair_reax_c.cpp:308)
|
||||
Loading…
Reference in New Issue