forked from lijiext/lammps
convert gpu lib to use c++-style include files
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ff6507e7b7
commit
3394d18a2a
lib/gpu
cudpp_mini
geryon
lal_answer.hlal_atom.hlal_balance.hlal_beck_ext.cpplal_born_coul_long_ext.cpplal_born_coul_wolf_ext.cpplal_born_ext.cpplal_buck_coul_ext.cpplal_buck_coul_long_ext.cpplal_buck_ext.cpplal_charmm_long_ext.cpplal_colloid_ext.cpplal_coul_debye_ext.cpplal_coul_dsf_ext.cpplal_coul_ext.cpplal_coul_long_ext.cpplal_device.cpplal_device.hlal_dipole_lj_ext.cpplal_dipole_lj_sf_ext.cpplal_dpd_ext.cpplal_eam_alloy_ext.cpplal_eam_ext.cpplal_eam_fs_ext.cpplal_gauss_ext.cpplal_gayberne_ext.cpplal_lj96_ext.cpplal_lj_class2_long_ext.cpplal_lj_coul_debye_ext.cpplal_lj_coul_ext.cpplal_lj_coul_long_ext.cpplal_lj_coul_msm_ext.cpplal_lj_cubic_ext.cpplal_lj_dsf_ext.cpplal_lj_expand_ext.cpplal_lj_ext.cpplal_lj_gromacs_ext.cpplal_lj_sdk_ext.cpplal_lj_sdk_long_ext.cpplal_mie_ext.cpplal_morse_ext.cpplal_neighbor.cpplal_pppm_ext.cpplal_re_squared_ext.cpplal_soft_ext.cpplal_sw_ext.cpplal_table_ext.cpplal_tersoff_ext.cpplal_tersoff_mod_ext.cpplal_tersoff_zbl_ext.cpplal_ufm_ext.cpplal_vashishta_ext.cpplal_yukawa_colloid_ext.cpplal_yukawa_ext.cpplal_zbl_ext.cpp
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@ -300,7 +300,7 @@
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||||||
#ifndef __CUDPP_H__
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#ifndef __CUDPP_H__
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#define __CUDPP_H__
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#define __CUDPP_H__
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#include <stdlib.h> // for size_t
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#include <cstdlib> // for size_t
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#ifdef __cplusplus
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#ifdef __cplusplus
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extern "C" {
|
extern "C" {
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@ -16,7 +16,7 @@
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//#include "cudpp_spmvmult.h"
|
//#include "cudpp_spmvmult.h"
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#include "cudpp_radixsort.h"
|
#include "cudpp_radixsort.h"
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#include <assert.h>
|
#include <cassert>
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CUDPPPlanManager* CUDPPPlanManager::m_instance = NULL;
|
CUDPPPlanManager* CUDPPPlanManager::m_instance = NULL;
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@ -25,7 +25,7 @@
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#include <cuda.h>
|
#include <cuda.h>
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#include <cudpp.h>
|
#include <cudpp.h>
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#include <limits.h>
|
#include <limits.h>
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#include <float.h>
|
#include <cfloat>
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#if (CUDA_VERSION >= 3000)
|
#if (CUDA_VERSION >= 3000)
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#define LAUNCH_BOUNDS(x) __launch_bounds__((x))
|
#define LAUNCH_BOUNDS(x) __launch_bounds__((x))
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@ -1,7 +1,7 @@
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||||||
#ifndef NVD_MACROS_H
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#ifndef NVD_MACROS_H
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#define NVD_MACROS_H
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#define NVD_MACROS_H
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#include <stdio.h>
|
#include <cstdio>
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#include <cassert>
|
#include <cassert>
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#include <cuda.h>
|
#include <cuda.h>
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@ -1,7 +1,7 @@
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#ifndef OCL_MACROS_H
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#ifndef OCL_MACROS_H
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#define OCL_MACROS_H
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#define OCL_MACROS_H
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#include <stdio.h>
|
#include <cstdio>
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#include <cassert>
|
#include <cassert>
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#ifdef __APPLE__
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#ifdef __APPLE__
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@ -16,7 +16,7 @@
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#ifndef LAL_ANSWER_H
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#ifndef LAL_ANSWER_H
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#define LAL_ANSWER_H
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#define LAL_ANSWER_H
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#include <math.h>
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#include <cmath>
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#include "mpi.h"
|
#include "mpi.h"
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#if defined(USE_OPENCL)
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#if defined(USE_OPENCL)
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@ -16,7 +16,7 @@
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||||||
#ifndef PAIR_GPU_ATOM_H
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#ifndef PAIR_GPU_ATOM_H
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#define PAIR_GPU_ATOM_H
|
#define PAIR_GPU_ATOM_H
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#include <math.h>
|
#include <cmath>
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#include "mpi.h"
|
#include "mpi.h"
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#if defined(USE_OPENCL)
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#if defined(USE_OPENCL)
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@ -17,7 +17,7 @@
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#define LAL_BALANCE_H
|
#define LAL_BALANCE_H
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#include "lal_device.h"
|
#include "lal_device.h"
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#include <math.h>
|
#include <cmath>
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#define _HD_BALANCE_EVERY 25
|
#define _HD_BALANCE_EVERY 25
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#define _HD_BALANCE_WEIGHT 0.5
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#define _HD_BALANCE_WEIGHT 0.5
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@ -15,7 +15,7 @@
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#include <iostream>
|
#include <iostream>
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#include <cassert>
|
#include <cassert>
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#include <math.h>
|
#include <cmath>
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#include "lal_beck.h"
|
#include "lal_beck.h"
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@ -15,7 +15,7 @@
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#include <iostream>
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#include <iostream>
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#include <cassert>
|
#include <cassert>
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#include <math.h>
|
#include <cmath>
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#include "lal_born_coul_long.h"
|
#include "lal_born_coul_long.h"
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@ -15,7 +15,7 @@
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#include <iostream>
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#include <iostream>
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#include <cassert>
|
#include <cassert>
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#include <math.h>
|
#include <cmath>
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#include "lal_born_coul_wolf.h"
|
#include "lal_born_coul_wolf.h"
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@ -15,7 +15,7 @@
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#include <iostream>
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#include <iostream>
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#include <cassert>
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#include <cassert>
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#include <math.h>
|
#include <cmath>
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#include "lal_born.h"
|
#include "lal_born.h"
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@ -15,7 +15,7 @@
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#include <iostream>
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#include <iostream>
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#include <cassert>
|
#include <cassert>
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#include <math.h>
|
#include <cmath>
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#include "lal_buck_coul.h"
|
#include "lal_buck_coul.h"
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@ -15,7 +15,7 @@
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#include <iostream>
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#include <iostream>
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#include <cassert>
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#include <cassert>
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#include <math.h>
|
#include <cmath>
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#include "lal_buck_coul_long.h"
|
#include "lal_buck_coul_long.h"
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@ -15,7 +15,7 @@
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#include <iostream>
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#include <iostream>
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#include <cassert>
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#include <cassert>
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#include <math.h>
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#include <cmath>
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#include "lal_buck.h"
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#include "lal_buck.h"
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@ -15,7 +15,7 @@
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#include <iostream>
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#include <iostream>
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#include <cassert>
|
#include <cassert>
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#include <math.h>
|
#include <cmath>
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#include "lal_charmm_long.h"
|
#include "lal_charmm_long.h"
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@ -15,7 +15,7 @@
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#include <iostream>
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#include <iostream>
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#include <cassert>
|
#include <cassert>
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#include <math.h>
|
#include <cmath>
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#include "lal_colloid.h"
|
#include "lal_colloid.h"
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@ -15,7 +15,7 @@
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#include <iostream>
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#include <iostream>
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#include <cassert>
|
#include <cassert>
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#include <math.h>
|
#include <cmath>
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#include "lal_coul_debye.h"
|
#include "lal_coul_debye.h"
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@ -15,7 +15,7 @@
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#include <iostream>
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#include <iostream>
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#include <cassert>
|
#include <cassert>
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#include <math.h>
|
#include <cmath>
|
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#include "lal_coul_dsf.h"
|
#include "lal_coul_dsf.h"
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@ -15,7 +15,7 @@
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#include <iostream>
|
#include <iostream>
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#include <cassert>
|
#include <cassert>
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#include <math.h>
|
#include <cmath>
|
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#include "lal_coul.h"
|
#include "lal_coul.h"
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@ -15,7 +15,7 @@
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#include <iostream>
|
#include <iostream>
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#include <cassert>
|
#include <cassert>
|
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#include <math.h>
|
#include <cmath>
|
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#include "lal_coul_long.h"
|
#include "lal_coul_long.h"
|
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@ -16,7 +16,7 @@
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||||||
#include "lal_device.h"
|
#include "lal_device.h"
|
||||||
#include "lal_precision.h"
|
#include "lal_precision.h"
|
||||||
#include <map>
|
#include <map>
|
||||||
#include <math.h>
|
#include <cmath>
|
||||||
#ifdef _OPENMP
|
#ifdef _OPENMP
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||||||
#include <omp.h>
|
#include <omp.h>
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#endif
|
#endif
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||||||
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@ -22,7 +22,7 @@
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||||||
#include "lal_pppm.h"
|
#include "lal_pppm.h"
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||||||
#include "mpi.h"
|
#include "mpi.h"
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||||||
#include <sstream>
|
#include <sstream>
|
||||||
#include "stdio.h"
|
#include <cstdio>
|
||||||
#include <string>
|
#include <string>
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#include <queue>
|
#include <queue>
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@ -15,7 +15,7 @@
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#include <iostream>
|
#include <iostream>
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#include <cassert>
|
#include <cassert>
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#include <math.h>
|
#include <cmath>
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#include "lal_dipole_lj.h"
|
#include "lal_dipole_lj.h"
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@ -15,7 +15,7 @@
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#include <iostream>
|
#include <iostream>
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#include <cassert>
|
#include <cassert>
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#include <math.h>
|
#include <cmath>
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#include "lal_dipole_lj_sf.h"
|
#include "lal_dipole_lj_sf.h"
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@ -15,7 +15,7 @@
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#include <iostream>
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#include <iostream>
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#include <cassert>
|
#include <cassert>
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#include <math.h>
|
#include <cmath>
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#include "lal_dpd.h"
|
#include "lal_dpd.h"
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@ -15,7 +15,7 @@
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#include <iostream>
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#include <iostream>
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#include <cassert>
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#include <cassert>
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#include <math.h>
|
#include <cmath>
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#include "lal_eam.h"
|
#include "lal_eam.h"
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@ -15,7 +15,7 @@
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#include <iostream>
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#include <iostream>
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#include <cassert>
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#include <cassert>
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#include <math.h>
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#include <cmath>
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#include "lal_eam.h"
|
#include "lal_eam.h"
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@ -15,7 +15,7 @@
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#include <iostream>
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#include <iostream>
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#include <cassert>
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#include <cassert>
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#include <math.h>
|
#include <cmath>
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#include "lal_eam.h"
|
#include "lal_eam.h"
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@ -15,7 +15,7 @@
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#include <iostream>
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#include <iostream>
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#include <cassert>
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#include <cassert>
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#include <math.h>
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#include <cmath>
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#include "lal_gauss.h"
|
#include "lal_gauss.h"
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@ -15,7 +15,7 @@
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#include <iostream>
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#include <iostream>
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#include <cassert>
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#include <cassert>
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#include <math.h>
|
#include <cmath>
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#include "lal_gayberne.h"
|
#include "lal_gayberne.h"
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@ -15,7 +15,7 @@
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#include <iostream>
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#include <iostream>
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#include <cassert>
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#include <cassert>
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#include <math.h>
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#include <cmath>
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#include "lal_lj96.h"
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#include "lal_lj96.h"
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@ -15,7 +15,7 @@
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#include <iostream>
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#include <iostream>
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#include <cassert>
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#include <cassert>
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#include <math.h>
|
#include <cmath>
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#include "lal_lj_class2_long.h"
|
#include "lal_lj_class2_long.h"
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@ -15,7 +15,7 @@
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#include <iostream>
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#include <iostream>
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#include <cassert>
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#include <cassert>
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#include <math.h>
|
#include <cmath>
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#include "lal_lj_coul_debye.h"
|
#include "lal_lj_coul_debye.h"
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@ -15,7 +15,7 @@
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#include <iostream>
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#include <iostream>
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#include <cassert>
|
#include <cassert>
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#include <math.h>
|
#include <cmath>
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#include "lal_lj_coul.h"
|
#include "lal_lj_coul.h"
|
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@ -15,7 +15,7 @@
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#include <iostream>
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#include <iostream>
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#include <cassert>
|
#include <cassert>
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#include <math.h>
|
#include <cmath>
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#include "lal_lj_coul_long.h"
|
#include "lal_lj_coul_long.h"
|
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@ -15,7 +15,7 @@
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#include <iostream>
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#include <iostream>
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#include <cassert>
|
#include <cassert>
|
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#include <math.h>
|
#include <cmath>
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#include "lal_lj_coul_msm.h"
|
#include "lal_lj_coul_msm.h"
|
||||||
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@ -15,7 +15,7 @@
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#include <iostream>
|
#include <iostream>
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#include <cassert>
|
#include <cassert>
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#include <math.h>
|
#include <cmath>
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#include "lal_lj_cubic.h"
|
#include "lal_lj_cubic.h"
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@ -15,7 +15,7 @@
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#include <iostream>
|
#include <iostream>
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#include <cassert>
|
#include <cassert>
|
||||||
#include <math.h>
|
#include <cmath>
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#include "lal_lj_dsf.h"
|
#include "lal_lj_dsf.h"
|
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@ -15,7 +15,7 @@
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||||||
#include <iostream>
|
#include <iostream>
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#include <cassert>
|
#include <cassert>
|
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#include <math.h>
|
#include <cmath>
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#include "lal_lj_expand.h"
|
#include "lal_lj_expand.h"
|
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@ -15,7 +15,7 @@
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||||||
#include <iostream>
|
#include <iostream>
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#include <cassert>
|
#include <cassert>
|
||||||
#include <math.h>
|
#include <cmath>
|
||||||
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#include "lal_lj.h"
|
#include "lal_lj.h"
|
||||||
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||||||
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@ -15,7 +15,7 @@
|
||||||
|
|
||||||
#include <iostream>
|
#include <iostream>
|
||||||
#include <cassert>
|
#include <cassert>
|
||||||
#include <math.h>
|
#include <cmath>
|
||||||
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||||||
#include "lal_lj_gromacs.h"
|
#include "lal_lj_gromacs.h"
|
||||||
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@ -15,7 +15,7 @@
|
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|
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||||||
#include <iostream>
|
#include <iostream>
|
||||||
#include <cassert>
|
#include <cassert>
|
||||||
#include <math.h>
|
#include <cmath>
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#include "lal_lj_sdk.h"
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#include "lal_lj_sdk.h"
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@ -15,7 +15,7 @@
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#include <iostream>
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#include <iostream>
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#include <cassert>
|
#include <cassert>
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#include <math.h>
|
#include <cmath>
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#include "lal_lj_sdk_long.h"
|
#include "lal_lj_sdk_long.h"
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@ -15,7 +15,7 @@
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#include <iostream>
|
#include <iostream>
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#include <cassert>
|
#include <cassert>
|
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#include <math.h>
|
#include <cmath>
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#include "lal_mie.h"
|
#include "lal_mie.h"
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@ -15,7 +15,7 @@
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#include <iostream>
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#include <iostream>
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#include <cassert>
|
#include <cassert>
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#include <math.h>
|
#include <cmath>
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#include "lal_morse.h"
|
#include "lal_morse.h"
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@ -17,7 +17,7 @@
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||||||
#include "lal_precision.h"
|
#include "lal_precision.h"
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||||||
#include "lal_neighbor.h"
|
#include "lal_neighbor.h"
|
||||||
#include "lal_device.h"
|
#include "lal_device.h"
|
||||||
#include "math.h"
|
#include <cmath>
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using namespace LAMMPS_AL;
|
using namespace LAMMPS_AL;
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int Neighbor::bytes_per_atom(const int max_nbors) const {
|
int Neighbor::bytes_per_atom(const int max_nbors) const {
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@ -15,7 +15,7 @@
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||||||
#include <iostream>
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#include <iostream>
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#include <cassert>
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#include <cassert>
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#include <math.h>
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#include <cmath>
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#include "lal_pppm.h"
|
#include "lal_pppm.h"
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@ -15,7 +15,7 @@
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#include <iostream>
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#include <iostream>
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#include <cassert>
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#include <cassert>
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#include <math.h>
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#include <cmath>
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#include "lal_re_squared.h"
|
#include "lal_re_squared.h"
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@ -15,7 +15,7 @@
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#include <iostream>
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#include <iostream>
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#include <cassert>
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#include <cassert>
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#include <math.h>
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#include <cmath>
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#include "lal_soft.h"
|
#include "lal_soft.h"
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@ -15,7 +15,7 @@
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#include <iostream>
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#include <iostream>
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#include <cassert>
|
#include <cassert>
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#include <math.h>
|
#include <cmath>
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#include "lal_sw.h"
|
#include "lal_sw.h"
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@ -15,7 +15,7 @@
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#include <iostream>
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#include <iostream>
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#include <cassert>
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#include <cassert>
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#include <math.h>
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#include <cmath>
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#include "lal_table.h"
|
#include "lal_table.h"
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@ -15,7 +15,7 @@
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#include <iostream>
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#include <iostream>
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#include <cassert>
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#include <cassert>
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#include <math.h>
|
#include <cmath>
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#include "lal_tersoff.h"
|
#include "lal_tersoff.h"
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@ -15,7 +15,7 @@
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#include <iostream>
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#include <iostream>
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#include <cassert>
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#include <cassert>
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#include <math.h>
|
#include <cmath>
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#include "lal_tersoff_mod.h"
|
#include "lal_tersoff_mod.h"
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@ -15,7 +15,7 @@
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#include <iostream>
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#include <iostream>
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#include <cassert>
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#include <cassert>
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#include <math.h>
|
#include <cmath>
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#include "lal_tersoff_zbl.h"
|
#include "lal_tersoff_zbl.h"
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@ -17,7 +17,7 @@
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#include <iostream>
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#include <iostream>
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#include <cassert>
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#include <cassert>
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#include <math.h>
|
#include <cmath>
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#include "lal_ufm.h"
|
#include "lal_ufm.h"
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@ -15,7 +15,7 @@
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#include <iostream>
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#include <iostream>
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#include <cassert>
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#include <cassert>
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#include <math.h>
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#include <cmath>
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#include "lal_vashishta.h"
|
#include "lal_vashishta.h"
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using namespace LAMMPS_AL;
|
using namespace LAMMPS_AL;
|
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@ -15,7 +15,7 @@
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#include <iostream>
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#include <iostream>
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#include <cassert>
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#include <cassert>
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#include <math.h>
|
#include <cmath>
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#include "lal_yukawa_colloid.h"
|
#include "lal_yukawa_colloid.h"
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@ -15,7 +15,7 @@
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#include <iostream>
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#include <iostream>
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#include <cassert>
|
#include <cassert>
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#include <math.h>
|
#include <cmath>
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#include "lal_yukawa.h"
|
#include "lal_yukawa.h"
|
||||||
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@ -15,7 +15,7 @@
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#include <iostream>
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#include <iostream>
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#include <cassert>
|
#include <cassert>
|
||||||
#include <math.h>
|
#include <cmath>
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#include "lal_zbl.h"
|
#include "lal_zbl.h"
|
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